《枪神》根据由内藤泰弘先生的漫画原作漫画版TRIGUN（トライガン）改编。 故事从梅丽鲁和米丽——两位自称来自贝露那堤保险协会的少女，缉拿“世纪大飓风”的线索开始。
Panty（小笠原亚里沙 配音）和Stocking（伊濑茉莉也 配音）本是两位天使，却因为他们桀骜不驯的作风而被逐出了天堂，来到了堕天城。在这里，姐妹两人遇见了名为Garterbelt（石井康嗣 配音）的神父，在这位拥有着神秘过去的神父的带领下，Panty和Stocking成为了恶灵狩猎者，通过狩猎恶灵得到天堂金币，当天堂金币积攒到了一定的数量之时，Panty和Stocking便可以借此重新返回天堂。就这样，两人在堕天城的日常就此拉开了序幕。
在一场车祸中，长井惠（佐藤贤三饰演）意外发现自己是个“亚洲人”。亚洲人拥有与人类相同的外表，拥有惊人的自我修复能力和永生。为了获得亚洲人的神秘力量，政府逮捕并监禁了今天被发现的亚洲人，包括吉永井，并对他们进行了残酷的活体实验。
