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在第二次新吉恩战争、别名“夏亚的叛乱”终结后,地球圈取得了短暂的和平。 这之后3年,宇宙世纪0096年。在工业殖民地“工业7号”上进行了一项秘密交涉。
時はクイーンズブレイドが、流浪の戦士レイナの優勝で終わった頃。 宮廷魔術師の一人アリシアは、魔術の鍛錬中に出現した次元の扉から、出てきたウサギに引き込まれ 別次元「メルフェアランド」へと迷い込んでしまう。