《灼眼的夏娜》TV第二季的故事将从小说第八卷开始讲起，以NDS游戏《灼眼的夏娜DS》中的登场人物，红世之徒，戏睡乡“メア”入侵御崎市开始开篇。据监督渡部高志所说，故事会对第一季的一些伏笔作出解释，并加入不少这个时代的小故事。
不明身份的怪物突然出现了。在超现实的世界观中，“可怕的”“宠物怪物”层出不穷，而且它们猖獗。它们看起来像玩具，看起来和动作都是人类的假设。人类有未来吗？
东都总医院给一名困难患者服用了一种新药，该患者在三天后死于突发心肌梗死。患者的遗孀中原直美（由吉濑美智子饰演）悲痛欲绝。她认为丈夫死于医疗事故，因此她要求“勒索律师”Kojo和Ma（由Tomoto Ohmori饰演）对医院提出指控。
