故事发生在真实的森林中,神秘的神秘现象频繁发生。根据一些目击事件,主人公的未知恐惧遇到了未知的“那个”。
一股平静的风吹过美丽的阿斯特拉大地。在大陆的一个角落里,失去记忆的男孩有树醒来了。他由他的小向导可可·洛、总是饥肠辘辘的美少女剑客佩科拉姆和略显冷漠的猫耳朵魔法少女凯露照顾。在命运的指引下,他们成立了一个名为“食堂”的行会。
三年前太空飞船猎户号坠毁学园都市,由此引发了严重的惨剧,而该事件也促成宇宙电梯恩底弥翁(Endymion)的建设。在恩底弥翁接近完工的前夕,上条当麻(阿部敦 配音)和茵蒂克丝(井口裕香 配音)揭示了热爱歌唱的少女鸣护亚丽莎。