为了继承父亲小野久郎（也由小山里配音）的遗嘱，高中生小野研吾（由樱井高弘配音）进入贵族学校的深流学院学习如何成为一名合格的校长。而且，在接下来的两年里，研吾还必须在学院里找到一个可以托付一生的婚姻伴侣。
战争之后，日本被分为南北两个部分。美军统治下的青森县，少年藤泽浩纪和白川拓也都喜欢同年级的同学泽度佐由理。他们的心中都有佐由理，还有那个东西——边境以北的津轻海峡，日本北海道联盟建立的高耸云端的“塔”。
故事发生在遥远的2020年，在与神秘生物“原生动物”的战争中，人类第一次体验到了彻底失败的滋味。土地被剥夺，权利被挤压，在残酷的独裁统治下，人类被迫过着压抑的生活，过着贫困的生活。然而，即便如此，强者仍然没有放弃反抗的机会。
