人气高中生矢口八虎觉得生活很无聊,在从一副绘画中找到灵感后,他纵身投入了美丽却又无情的艺术世界。
可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。 然而在世界受到这样的威胁时,有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。 在那场传奇的战斗中,「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒,成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界,然后却突然消声匿迹了,而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播,成为了传说。 而现在,作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作,为了寻找过去发生的某件事件的真相,对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机,命运的齿轮就此转动…… 迷之AI的真身,「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的,以及隐藏在游作过去的真相到底是——— 所有的答案,都在「Link Vrains」中
然而,由于担心长期战争会导致国力下降,女神们最终缔结了一项“友谊条约”,禁止使用武力争夺份额。就这样,游戏行业进入了一个新的未来,四个国家的女神和候补姐妹也开始了新的生活。