为了书可以去做巫女！ 「比起一日三餐更喜欢书」的女大学生·本须丽乃转生成为士兵的女儿·梅茵的那个世界中，并没有书。 平民的识字率低下，羊皮纸做出来的书十分昂贵，是贵族老爷专属的东西。 于是梅茵做了一个决定。
少年焰魔堂辘轳（花江夏树 配音）立志要成为史上最强阴阳师，却因为一场悲剧的发生而意识到灾难的不可逆转，遂放弃了理想，沦为路人。 某日，一位名叫化野红绪（潘惠美 配音）的京都少女出现在了辘轳的身边，两人在误打误撞之中开始了同居生活。红绪铲除污秽的决心渐渐感化了辘轳，让他再度看到了希望，燃起了热血。与此同时，辘轳发现，红绪的哥哥石镜悠斗（村濑步 配音）和当年令自己失去一切的灾难有着千丝万缕的关联。
平静的东京湾突然发生沉船事故。当人们还在怀疑海底火山是否爆发时，一只巨大的怪物从水中浮出水面，降落在城市里。日本政府领导成立了“不明生物大灾难省”，该省吸引了该国怪人的参与。
